Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công an đang tiến hành điều tra vụ án Lừa đảo chiếm đoạt tài sản; Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí; Lợi dụng chức vụ, quyền hạn gây ảnh hưởng đối với người khác để trục lợi xảy ra tại Công ty Cổ phần Tập đoàn Yên Khánh, Tổng Công ty Cửu Long và các đơn vị có liên quan trong việc đấu giá và thu phí tuyến cao tốc thành phố Hồ Chí Minh - Trung Lương.
Ngày 12/8/2020, Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công an đã ra Quyết định khởi tố bị can, Lệnh khám xét và áp dụng biện pháp ngăn chặn tạm giam 04 bị can về tội “Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí” theo điều 219 Bộ Luật hình sự 2015, gồm: Các bị can bị khởi tố là: Ông Đinh La Thăng, nguyên Bộ trưởng Bộ GTVT (hiện đang chấp hành án).
Ông Nguyễn Hồng Trường cựu Thứ trưởng Bộ GTVT; Ông Nguyễn Chí Thành, nguyên Phó Vụ trưởng Vụ Tài chính - Bộ GTVT; Ông Lê Trung Cường, chuyên viên Vụ Tài chính.
Cả 4 bị can bị khởi tố, bắt tạm giam về tội vi phạm quy định về sử dụng tài sản nhà nước gây thất thoát lãng phí theo Điều 219 bộ luật Hình sự 2015.
Theo Thiếu tướng Xô, các quyết định trên đã được Viện Kiểm sát nhân dân tối cao phê chuẩn.
Ông Đinh La Thăng sinh năm 1960, quê Nam Định. Ông Đinh La Thăng đã bị kết án trong 2 vụ án được xét xử sơ thẩm và phúc thẩm năm 2018, với tổng cộng 30 năm tù cùng về tội Cố ý làm trái quy định của Nhà nước về quản lý kinh tế gây hậu quả nghiêm trọng.
Vụ thứ nhất Tham ô tài sản, Cố ý làm trái quy định của Nhà nước về quản lý kinh tế gây hậu quả nghiêm trọng xảy ra tại Tập đoàn Dầu khí Việt Nam (PVN) và Tổng công ty xây lắp dầu khí (PVC); vụ thứ hai là vụ sai phạm gây thiệt hại 800 tỷ đồng cho PVN khi đơn vị này góp vốn vào OceanBank.
Tiếp đó, vào năm 2019, ông Đinh La Thăng bị Cơ quan An ninh điều tra Bộ Công an khởi tố về tội Vi phạm quy định về đầu tư công trình xây dựng gây hậu quả nghiêm trọng" quy định tại điều 224 Bộ luật hình sự trong vụ Ethanol Phú Thọ.