Cụ thể, khối ngành Răng Hàm Mặt và Y dược có mức học phí là 2,45 triệu đồng/tháng, khối ngành Sức khỏe có học phí là 1,85 triệu đồng/tháng và ngành Điều dưỡng chương trình tiên tiến là 3,7 triệu đồng/tháng.
Các bậc học thạc sĩ, tiến sĩ mức học phí gần 4 triệu đồng/tháng đến trên 6 triệu đồng/tháng.
Trước đó, Trường Đại học Y Hà Nội chưa thực hiện cơ chế tự chủ vì vậy học phí năm học 2021-2022 với sinh viên chính quy vẫn theo quy định tại Nghị định 86/2015/NĐ-CP về cơ chế thu, quản lý học phí với cơ sở giáo dục thuộc hệ thống giáo dục quốc dân, khoảng 14,3 triệu đồng/năm.
Như vậy, so với năm học trước, mức học phí của một số ngành tại Trường ĐH Y Hà Nội đã tăng lên khoảng 71,3%.