Nhằm đáp ứng nhu cầu khám, chữa bệnh bảo hiểm y tế của người dân, Bảo hiểm xã hội thành phố Hà Nội đã ký hợp đồng khám, chữa bệnh với 187 cơ sở y tế (25 bệnh viện tuyến trung ương; 46 bệnh viện tuyến thành phố; 15 bệnh viện tuyến huyện; 33 trung tâm y tế, 5 phòng khám đa khoa, 30 trung tâm y tế quận, huyện, thị xã…). Ngoài ra, hệ thống trạm y tế xã, phường, thị trấn có 515/584 cơ sở thực hiện khám, chữa bệnh bảo hiểm y tế. Như vậy, Hà Nội hiện có hơn 700 cơ sở khám, chữa bệnh bảo hiểm y tế, thông suốt từ tuyến trung ương đến cơ sở.
Những năm gần đây, trung bình mỗi năm, Bảo hiểm xã hội thành phố Hà Nội tổ chức giám định và thanh toán chi phí khám, chữa bệnh bảo hiểm y tế cho hơn 10 triệu lượt người với số chi khoảng 18.000 tỷ đồng, bằng gần 19% tổng số chi khám, chữa bệnh bảo hiểm y tế của cả nước.