Theo kết luận, có hai gói thầu mua khẩu trang y tế, trang phục phục vụ công tác phòng chống dịch do Trung tâm Kiểm soát bệnh tật TP.HCM làm chủ đầu tư đã xác định giá gói thầu trái với quy định, gây thiệt hại hơn 6 tỷ đồng.
Cơ quan thanh tra cũng phát hiện có dấu hiệu nhà thầu Công ty BBA và nhà thầu Công ty BNC thông thầu xảy ra tại hai gói thầu do Bệnh viện Từ Dũ làm chủ đầu tư và một gói thầu do Bệnh viện Nhi đồng thành phố làm chủ đầu tư.
Cũng theo kết luận, có 4 nhà thầu cung cấp một số loại trang thiết bị y tế thuộc các gói thầu do Sở Y tế làm chủ đầu tư, có giá trúng thầu cao bất thường so với giá vốn nhập khẩu. Điển hình là mặt hàng Máy X-quang di động DR do Công ty TNHH thương mại và công nghệ kỹ thuật TNT trúng thầu.
Kết quả xác minh cho thấy giá trúng thầu cao gấp 4,67 lần so với giá vốn nhập khẩu, với giá trị chênh lệch gần 19 tỷ đồng.
Ba thiết bị khác của Công ty TNT, Công ty TNHH vật tư và trang thiết bị y tế Hà Thành, Công ty CP Kỹ thuật và thiết bị y tế Sài Gòn cũng do Sở Y tế là chủ đầu tư, có giá bán cao bất thường với số tiền chênh lệch từ 5 tỷ đến gần 6 tỷ.
Tại một số bệnh viện, nhiều gói thầu mua sắm vật tư y tế, sinh phẩm, kit xét nghiệm và thuốc chữa bệnh Covid-19 có sự mua bán qua nhiều khâu trung gian, có chênh lệch lớn giữa giá trúng thầu với giá vốn nhập khẩu, hoặc giá bán của nhà sản xuất đối với hàng hóa sản xuất trong nước.
Điển hình là gói thầu "Mua sắm kit hoá chất dùng trong xét nghiệm Covid-19 bằng phương pháp PCR" do Bệnh viện Nhi đồng 1 làm chủ đầu tư. Sản phẩm kit tách chiết acid nucleic virus do QiaGen GmbH/Đức sản xuất, Công ty TNHH thiết bị y tế Phương Đông là nhà thầu trúng thầu, có giá trúng thầu cao gấp 2,59 lần so với giá vốn nhập khấu, với giá trị chênh lệch gần 6,7 tỷ đồng.
Gói thầu mua thuốc Generic điều trị bệnh nhân Covid-19 tại nhà (lần 1) do Bệnh viện Nhi đồng 1 làm chủ đầu tư: Đối với mặt hàng thuốc Xelostad lOmg, bệnh viện mua 300.000 viên của Công ty CP Gonsa với đơn giá 35.000 đồng/viên; tuy nhiên Công ty CP Gonsa mua lại thuốc của Công ty TNHH GSPHARM với đơn giá 21.000 đồng/viên; thuốc do Công ty TNHH liên doanh Stellpharm - Chi nhánh 1 sản xuất; Công ty TNHH GSPHARM cũng là một đơn vị trung gian. Như vậy, chỉ tính một khâu trung gian mua, bán của nhà thầu Công ty CP Gonsa, trong thời gian rất ngắn (5 ngày) số tiền chênh lệch do tăng giá là 4,2 tỷ đồng.
Gói thầu mua sắm 20.000 test chống dịch do Bệnh viện Bệnh nhiệt đới làm chủ đầu tư có sản phẩm bị bán giá chênh lệch hơn 4 tỷ và có sản phẩm giá chênh lệch đến hơn 14 tỷ. Tổng số tiền chênh lệch ba loại sản phẩm do bệnh viện này làm chủ đầu tư là hơn 20 tỷ.
Tương tự tại Bệnh viện Nhi đồng 2, Bệnh viện Nhi đồng thành phố có ba gói thầu đều "giá cao bất thường" chênh lệch mỗi gói hơn 1 tỷ. Tổng số các gói thầu có "dấu hiệu lợi dụng dịch bệnh nâng giá cao bất thường" tại 4 bệnh viện trên có chênh lệch lên đến gần 40 tỷ đồng.