Hồng Duy cho biết vợ chồng anh đã mua gói lưu trữ tế bào gốc cuống rốn để đề phòng rủi ro, bảo vệ sức khỏe của con trong tương lai. Việc có con giúp cựu cầu thủ HAGL thêm động lực phấn đấu trong sự nghiệp.
Nguyễn Phong Hồng Duy và bà xã Kiều Oanh cùng theo đạo Phật. Hai người quen nhau trong một chuyến thiện nguyện ở Bà Rịa - Vũng Tàu năm 2021. Cặp trai tài gái sắc tổ chức đám cưới hồi tháng 5 và tháng 6 năm nay tại Gia Lai và Bình Phước. Cả Hồng Duy và vợ đều kín tiếng, hiếm khi chia sẻ chuyện riêng tư.
Kiều Oanh sinh năm 1995, có bố là tổng giám đốc một công ty cao su. Cô tốt nghiệp thạc sĩ ngành Việt Nam học tại Đại học Sư phạm Đà Nẵng, từng tham gia một số cuộc thi sinh viên thanh lịch và có sự nghiệp kinh doanh riêng về mảng trang sức, đá quý phong thủy.
Hồng Duy sinh năm 1996, được nhiều người biết đến sau khi cùng U23 Việt Nam giành ngôi á quân U23 châu Á 2018. Anh sau đó thường xuyên được triệu tập lên tuyển quốc gia trong giai đoạn thành công của bóng đá Việt Nam dưới thời HLV Park Hang-seo.
Hồng Duy gia nhập CLB Nam Định đầu năm 2023 sau khi chia tay CLB HAGL. Anh thường xuyên được ra sân đá chính, góp phần giúp Thép xanh Nam Định vô địch V.League 2023/2024. Hồng Duy được HLV Kim Sang-sik triệu tập lên ĐT Việt Nam trong đợt tập trung thi đấu giao hữu FIFA Days tháng 10.
Mới đây, khi HLV Kim Sang-sik triệu tập danh sách sơ bộ ĐT Việt Nam để lên đường sang Hàn Quốc tập huấn, Hồng Duy không có tên. Nhưng lý do là vì anh bận cùng Thép xanh Nam Định tham dự lượt trận thứ 5 tại AFC Champions League Two 2024/2025. Theo một số nguồn tin, Hồng Duy cùng Văn Toàn, Nguyễn Văn Vĩ và Lý Công Hoàng Anh sẽ là 4 cái tên mà HLV Kim Sang-sik bổ sung lên ĐT Việt Nam sau chuyến tập huấn tại Hàn Quốc.