Đây là bệnh viện chuyên trách thứ hai (sau Bệnh viện dã chiến tại Củ Chi), với quy mô 300 giường chịu trách nhiệm cách ly và điều trị bệnh Covid-19.
Bệnh viện do các bác sĩ chuyên khoa Nhiễm, chuyên khoa Hồi sức, chuyên khoa Nội của các bệnh viện (BV): BV Bệnh Nhiệt đới, BV quận Thủ Đức, BV quận 2 và Trung tâm Y tế huyện Cần Giờ đảm trách. BV Bệnh Nhiệt đới cử một bác sĩ là Phó Giám đốc kiêm nhiệm phụ trách chuyên môn, Trung tâm Y tế huyện Cần Giờ cử một Phó Giám đốc chuyên trách hậu cần cho BV này.
Ngoài các bác sĩ và điều dưỡng của Trung tâm Y tế huyện Cần Giờ, Sở Y tế điều động các bác sĩ và điều dưỡng của BV Bệnh Nhiệt đới, BV quận Thủ Đức, BV quận 2 luân phiên đến công tác. Tất cả các bác sĩ, điều dưỡng tham gia công tác tại BV Cần Giờ sẽ được tập huấn nhiều chuyên đề liên quan đến chăm sóc người bệnh Covid-19.
PGS.TS Tăng Chí Thượng, Phó Giám đốc Sở Y tế TP.HCM cho biết, một thuận lợi khi Sở Y tế chọn Trung tâm Y tế huyện Cần Giờ làm bệnh viện điều trị Covid-19, chính là huy động nguồn lực sẵn có tại Trung tâm Y tế (vừa mới được ngân sách đầu tư xây mới với nhiều trang thiết bị cần thiết sẵn có), ít gây ảnh hưởng đến công tác chăm lo sức khoẻ người dân trên địa bàn.
Dân cư của huyện Cần Giờ ít và số lượt khám, chữa bệnh tại huyện Cần Giờ là thấp nhất trong các quận, huyện của thành phố. Sở Y tế có kế hoạch giao các BV lân cận như BV huyện Nhà Bè và các BV chuyên khoa của thành phố hỗ trợ chăm sóc người bệnh khi có nhu cầu.
Sở Y tế đang triển khai lắp đặt 10 phòng cách ly có áp lực âm tại khu cách ly người bệnh của BV này. Ngoài ra, Công ty Dịch vụ công ích Thanh niên xung phong ưu tiên hỗ trợ phà đưa đón xe chuyển bệnh đến Trung tâm Y tế Cần Giờ từ các khu cách ly, các BV khi có nhu cầu chuyển.