Do ảnh hưởng của gió mùa tây nam hoạt động mạnh, từ ngày 11 đến 24.9, ở trung và hạ lưu sông Mê Kông đã có mưa to đến rất to.
Tổng lượng mưa thu được phổ biến từ 100-300mm, có nơi mưa trên 700mm, như Sa Ra Van (Lào) 866mm, Pắc Sế (Lào) ít hơn 810mm, Kông Sê Đông (Lào) mưa 721mm. Do mưa lớn đều khắp khiến trung và hạ lưu sông Mê Kông xuất hiện một đợt lũ khá cao. Biên độ lũ dao động từ 3,5-6m; khu vực hạ lưu phổ biến từ 1,8-2m. Hiện lũ ở trung lưu sông Mê Kông đã đạt đỉnh và đang xuống, lũ tại hạ lưu đang lên.
Hồi 7 giờ ngày 27.9, các trạm Thủy văn nước Căm Pu Chia quan trắc được mực nước trên sông Mê Kông như sau: Tại Stung Treng đạt mức 11,33m; Kra Chiên lên tới 22,69m. Cảng Phnông Pênh lên đến 9,14m; tại trạm Phnôm Pênh Basacc dâng tới 9,98m.
Lũ từ đầu nguồn sông Mê Kông dồn về đẩy mực nước đầu nguồn sông Cửu Long nước ta đang lên. Lúc 7 giờ 27.9, trạm Thủy văn Tân Châu (An Giang) quan trắc được mực nước trên sông Tiền lên tới 3,75m. Trên BĐ1 là 0,25m; tại Châu Đốc (An Giang) đạt mức 3,03; vượt BĐ1 là 0,03m.
Dự báo trong những ngày tới do lũ thượng nguồn tiếp tục đổ về, kết hợp với thời kỳ triều cường đẩy mực nước đầu nguồn sông Cửu Long tiếp tục lên. Đến ngày 1.10, trên sông Tiền tại Tân Châu có khả năng lên đến 4,0m (đạt mức BĐ2). Trên sông Hậu tại Châu Đốc khả năng dâng tới 3,2m (trên BĐ1 khoảng 0,2). Sau đó mực nước còn tiếp tục lên.