Ở trận derby phía Bắc thành London tại vòng 3 FA Cup diễn ra trên sân Emirates vào rạng sáng ngày 5.1 (giờ Việt Nam), Walcott đã bị dính chấn thương và phải rời sân bằng cáng ở phút 83. Tuy nhiên do đã hết quyền thay người nên The Gunners chỉ còn chơi với 10 người trên sân.
Mặc dù lãnh đạo Arsenal chưa đưa ra bất cứ lời bình luận gì về chấn thương của Walcott, song trên trang web chính thức của đội chủ sân Emirates đã xác nhận rằng, ngôi sao 24 tuổi sẽ phải nghỉ dưỡng thương ít nhất 6 tháng.
Điều đó có nghĩa, mùa giải 2013-2014 đã chính thức khép lại đối với Walcott. Chắc chắn, đây sẽ là một tổn thất không nhỏ đối với Arsenal trong bối cảnh mà họ đang nỗ lực tìm kiếm danh hiệu đầu tiên sau gần 9 năm “trắng tay”. Trong mấy năm gần đây, cầu thủ sinh năm 1989 luôn được xem là sự lựa chọn không thể thay thế nơi hành lang cánh phải của Pháo thủ thành London.
Ngoài ra, Walcott cũng không thể kịp bình phục chấn thương để cùng đội tuyển Anh tham dự vòng chung kết World Cup 2014 diễn ra ở Brazil vào mùa hè tới.
Mùa giải này, Walcott mới có 13 lần ra sân tại Premier League, ghi được 5 bàn thắng và 4 đường kiến tạo cơ hội cho đồng đội lập công.