Theo đó, VNPT có một số sai phạm về quản lý, sử dụng vốn và tài sản như: Bàn giao vốn điều lệ cho VNPost (Tổng Cty Bưu điện Việt Nam) chưa đúng thời gian quy định 796 tỷ đồng; chậm đóng quỹ Dịch vụ viễn thông công ích (VTCI) hơn 73 tỷ đồng, chưa xác định số tiền phải nộp quỹ này trong 2 năm (2011, 2012), riêng Cty Thông tin Di động (VMS, thuộc VNPT) đã trích vượt chị phí nộp quỹ VTCI đến năm 2011 gần 194 tỷ đồng, chưa nộp quỹ năm này gần 497 tỷ đồng.
Một số vật tư, thiết bị khi mua về không sử dụng hết, kinh doanh khai thác kém hiệu quả, nhiều dự án phải dừng đầu tư, gây lãng phí, thiệt hại về vốn như: Dự án cáp đồng đang tồn kho vật tư cáp các loại trị giá hơn 70,4 tỷ đồng; dự án Cityphone lỗ và tài sản không khấu hao hết tổng cộng hơn 168,5 tỷ đồng; chậm tiến độ dự án cáp quang biển trục Bắc – Nam (tổng mức đầu tư gần 3.000 tỷ đồng bằng nguồn vốn ODA) gần 10 năm; dự án Vinasat I, II mức đầu tư 9.280 tỷ đồng nhưng đến thời điểm năm 2011 chưa đảm bảo hiệu quả kinh doanh như kế hoạch dự án được phê duyệt, lỗ vượt dự kiến 329 tỷ đồng.
Ngoài ra, TTCP cũng phát hiện nhiều sai phạm về quản lý đầu tư tài chính dài hạn; quản lý và sự dụng đất đai; việc quản lý doanh thu, chi phí, kết quả hoạt động kinh doanh và thực hiện nghĩa vụ thuế đối với ngân sách Nhà nước tại VNPT và các đơn bị thành viên.
Từ kết quả trên, TTCP đã kiến nghị thu hồi về ngân sách Nhà nước hơn 105 tỷ đồng gồm các khoản thuế do VNPT và các đơn vị thành viên chưa thực hiện. TTCP cũng kiến nghị Chính phủ chỉ đạo Bộ Tài Chính, Bộ Thông tin và Truyền thông và VNPT tổ chức kiểm điểm, xử lý các đơn vị, cá nhân có liên quan đến sai phạm.
Văn phòng Chính phủ cũng đã có Văn bản số 5801/VPCP-V.I gửi TTCP và Bộ Thông tin và Truyền thông; Bộ Tài chính; VNPT để truyền đạt ý kiến của Phó Thủ tướng Chính phủ Nguyễn Xuân Phúc về việc xử lý sau thanh tra VNPT. Phó thủ tướng đồng ý với các kiến nghị xử lý của kết luận thanh tra, yêu cầu các cơ quan trên thực hiện kiến nghị của TTCP, báo cáo kết quả lên Thủ tướng trong tháng 9.2013.