Theo Điều 258, Bộ luật Tố tụng hình sự về thủ tục xem xét bản án tử hình trước khi đưa ra thi hành:
1. Sau khi bản án tử hình có hiệu lực pháp luật, hồ sơ vụ án phải được gửi ngay lên Chánh án Tòa án Nhân dân Tối cao và bản án phải được gửi ngay lên Viện trưởng Viện Kiểm sát Nhân dân Tối cao.
Trong thời hạn hai tháng, kể từ ngày nhận được bản án và hồ sơ vụ án, Chánh án Tòa án Nhân dân Tối cao, Viện trưởng Viện Kiểm sát Nhân dân Tối cao phải quyết định kháng nghị hoặc quyết định không kháng nghị giám đốc thẩm hoặc tái thẩm.
Trong thời hạn bảy ngày, kể từ ngày bản án có hiệu lực pháp luật, người bị kết án được gửi đơn xin ân giảm lên Chủ tịch nước.
2. Bản án tử hình được thi hành, nếu Chánh án Toà án Nhân dân Tối cao và Viện trưởng Viện Kiểm sát Nhân dân Tối cao không kháng nghị theo thủ tục giám đốc thẩm hoặc tái thẩm.
Trong trường hợp người bị kết án xin ân giảm hình phạt tử hình thì bản án tử hình được thi hành sau khi Chủ tịch nước bác đơn xin ân giảm.
Như vậy, Dương Chí Dũng và Mai Văn Phúc vẫn còn cơ hội được sống khi gửi đơn xin ân giảm lên Chủ tịch nước.
Trong vụ án này ngoài Dương Chí Dũng và Mai Văn Phúc bị tuyên án tử hình, các bị cáo khác bị tuyên như sau:
Trần Hải Sơn (54 tuổi, nguyên Tổng giám đốc Công ty TNHH sửa chữa tàu biển Vinalines): 14 năm tù về tội tham ô tài sản; 8 năm tù về tội cố ý làm trái (tổng hợp hình phạt 22 năm tù cho cả hai tội danh).
Trần Hữu Chiều (62 tuổi, nguyên Phó tổng giám đốc Vinalines): 19 năm cho hai tội danh tham ô và cố ý làm trái.
Mai Văn Khang (56 tuổi, nguyên Phó tổng giám đốc Công ty TNHH một thành viên Vận tải viễn dương Vinashin thuộc Vinalines): 7 năm về hành vi cố ý làm trái.
Lê Văn Dương (44 tuổi, đăng kiểm viên Chi cục Đăng kiểm số 6, Cục Đăng kiểm Việt Nam): 7 năm tù.
Huỳnh Hữu Đức (49 tuổi, nguyên Phó chi cục trưởng Chi cục Hải quan Vân Phong, tỉnh Khánh Hòa, nguyên Phó chánh văn phòng Cục Hải quan tỉnh Khánh Hòa): 6 năm tù.
Lê Văn Lừng (55 tuổi, nguyên cán bộ Chi cục Hải quan Vân Phong, tỉnh Khánh Hòa): 6 năm tù.
Lê Ngọc Triện (50 tuổi, nguyên Đội trưởng Đội nghiệp vụ Chi cục Hải quan Vân Phong, Cục Hải quan tỉnh Khánh Hòa): 6 năm tù.
Ba bị cáo nguyên là cán bộ hải quan được chấp nhận kháng án, giảm nhẹ một phần hình phạt tù về tội cố ý làm trái, mỗi bị cáo được giảm 2 năm tù (từ 8 năm xuống 6 năm tù). Riêng bị cáo Bùi Thị Bích Loan (SN 1963) - nguyên Kế toán trưởng Vinalines - bị cấp sơ thẩm tuyên 4 năm tù về tội cố ý làm trái, bị cáo này đã không kháng cáo.