Theo lãnh đạo nhiều trường ĐH được giao chủ trì cụm thi, hai khâu khó nhất trong việc tổ chức thi cụm là công tác sao in đề và chấm thi, hai khâu này đòi hỏi sự phối hợp chặt chẽ giữa các trường ĐH và các sở GDĐT địa phương.
Ngoài khâu tổ chức in sao đề, một khó khăn không nhỏ với các trường được giao chủ trì cụm thi là khâu chấm thi. Ông Phạm Thái Sơn - Phó Trưởng phòng Đào tạo Trường ĐH Công nghiệp Thực phẩm TP.HCM, cho biết: Trường không có giáo viên sử, địa. Vì vậy, dự kiến chúng tôi sẽ ký hợp đồng với các trường THPT uy tín để chấm các môn tự luận. Không chỉ có ĐH Công nghiệp Thực phẩm, nhiều trường chuyên về khối A, B như ĐH Sư phạm Kỹ Thuật TP.HCM, ĐH Y Dược TP.HCM… cũng lo thiếu giáo viên chấm các môn sử, địa, văn. Trong khi đó, ông Mai Quốc Chính - Trưởng ban Đào tạo ĐHQG TP.HCM, cũng nhận định: Công tác chấm thi năm nay sẽ rất căng thẳng nên các trường tổ chức thi cụm phải phối hợp chặt chẽ với các sở GDĐT để có giáo viên chấm thi, nhất là các môn tự luận. Ngoài ra, các trường được giao chủ trì cụm cũng phải chuẩn bị chu đáo về nhân sự và cơ sở vật chất để tổ chức kì thi nghiêm túc, khách quan, kết quả đảm bảo độ tin cậy để các trường ĐH, CĐ làm căn cứ để tuyển sinh.