Chiếc Airbus A321 mang số hiệu KGL9268 của hãng hàng không Nga Kogalymavia khởi hành từ thành phố Sharm el Sheikh, khu nghỉ mát nổi tiếng của Ai Cập lúc 5h51 (giờ địa phương) ngày 31.10 và đang hướng tới thành phố St Petersburg. Khoảng 22 phút sau, kiểm soát không lưu mất liên lạc với chiếc máy bay. Lúc này chiếc máy bay đang bay ở độ cao 9.450 mét.
Sau đó, chiếc phi cơ chở 224 người được xác định rơi trên sa mạc gần thị trấn Hasna ở phía bắc của bán đảo Sinai. Chiếc phi cơ được cho là đã lao nhanh xuống đất, theo phương thẳng đứng. Ông Aleksandr Neradko, người đứng đầu cơ quan hàng không Nga Rosaviatsia cho hay, "đến nay tất cả các dấu hiệu đều chứng tỏ rằng, máy bay đã bị nổ tung trong không trung".
Video xác máy bay Nga bị cháy rụi sau khi rơi xuống đất, các mảnh vỡ và hành lý của hành khách nằm rải rác trong khu vực có diện tích khoảng 20 km2.