Trước đây Yamaha R3 xuất hiện chỉ có 3 tông màu: đỏ, xanh đua và đen đêm. Nhưng mới đây tại triển lãm xe ở Bangkok, Thái Lan, Yamaha đã khoác thêm bộ áo xám xịt cho R3 khiến mẫu xe này thêm vẻ hung dữ.
Đi kèm với màu mới, thân xe cũng có thiết kế đồ họa mới.
Còn lại xe vẫn giữ nguyên các chi tiết cơ khí trước đây.
Xe trang bị động cơ FI, đôi xy-lanh, dung tích 321 cc, làm mát bằng chất lỏng, sản sinh công suất 42 mã lực tại 10.750 vòng/phút và mô-men xoắn cực đại 29.6 Nm tại 9.000 vòng/phút.
Đi kèm với đó là loại hộp số 6 cấp. Ở phần bình xăng của xe được thiết kế một dải vệt đen tạo ấn tượng mạnh mẽ cho xe.
R3 trang bị bộ phuộc lồng phía trước và bộ giảm sóc phía sau.
Cả bánh trước và sau của xe đều có phanh đĩa.
Bình xăng cỡ lớn.
Phía trước có kính chắn gió.