Tại Công ty Faros, Cơ quan điều tra Bộ Công an cáo buộc Trịnh Văn Quyết và đồng phạm "phù phép", nâng khống vốn của doanh nghiệp này từ 1,5 tỷ đồng lên 4.300 tỷ đồng.
Sau đó, bị can đề nghị đăng ký niêm yết 430 triệu cổ phiếu ROS của Công ty CP Xây dựng Faros trên Sở giao dịch chứng khoán TP.HCM để bán, chiếm đoạt 3.620 tỷ đồng của các nhà đầu tư. Trịnh Văn Quyết do vậy bị cáo buộc phạm tội "Lừa đảo chiếm đoạt tài sản".
Một trong những nội dung được Viện KSND Tối cao yêu cầu làm rõ là "xem xét, xử lý trách nhiệm" các cá nhân là thành viên các đoàn kiểm tra với hoạt động của Công ty Faros trên Sở Giao dịch chứng khoán TP.HCM (HOSE).
Phía điều tra xác định, năm 2017, Bộ Tài chính có quyết định kiểm tra tại Công ty Faros và việc giao dịch cổ phiếu Faros (mã ROS) tại 7 công ty chứng khoán; kiểm tra việc kinh doanh và tăng vốn, sử dụng vốn cho hoạt động kinh doanh…
Cùng năm, Đoàn kiểm tra gồm 21 thành viên thuộc Bộ Tài chính tiến hành kiểm tra tại Công ty Faros, Công ty Chứng khoán BOS và 6 công ty là: Chứng khoán Bảo Việt, Chứng khoán Phương Nam, Chứng khoán Sài Gòn Hà Nội, Chứng khoán Ngân hàng BIDV, Chứng khoán Đại Nam, Chứng khoán Alpha.
Đoàn kiểm tra đã phát hiện một số dấu hiệu bất thường trong việc góp vốn và sử dụng vốn góp tại Công ty Faros đồng thời thu thập được các chứng từ kế toán thể hiện số vốn góp được chuyển vào tài khoản Faros được sử dụng chủ yếu vào các hoạt động đầu tư tài chính.
Mặc dù phát hiện bất thường nhưng theo thẩm quyền, Đoàn kiểm tra của Bộ Tài chính không có khả năng điều tra, xác minh: "Để kiểm tra về khả năng góp vốn và đã vốn đủ vốn theo cam kết", kết luận điều tra bổ sung nêu.
Đoàn kiểm tra sau đó tham vấn Ngân hàng Nhà nước, Bộ Kế hoạch Đầu tư, cho kết quả không đủ căn cứ xử lý với các vi phạm của Công ty Faros nên chỉ tham mưu Bộ Tài chính kiến nghị Thủ tướng chỉ đạo các bộ ngành liên quan rà soát quy định pháp luật.
Quá trình điều tra, cảnh sát không phát hiện vi phạm trong hoạt động thanh kiểm tra của Đoàn kiểm tra Bộ Tài chính nên không xem xét trách nhiệm với 21 thành viên.
Ngoài Bộ Tài chính, HOSE cũng từng lập Đoàn vào năm 2016 để kiểm tra trực tiếp về niêm yết chứng khoán và giao dịch cổ phiếu quỹ.
Đoàn của HOSE đã kiểm tra việc thực hiện các quy định về niêm yết chứng khoán, gồm hồ sơ chấp thuận niêm yết mã chứng khoán ROS của Công ty Faros. Nhưng theo quy định, Đoàn không có thẩm quyền thẩm định lại hồ sơ chấp thuận niêm yết của HOSE nên không phát hiện vi phạm. Cảnh sát do vậy không xử lý các thành viên trong Đoàn.
Bên cạnh hành vi lợi dụng việc bán cổ phiếu của Faros để lừa đảo nên trên, Trịnh Văn Quyết còn chịu cáo buộc tạo giao dịch chéo với nhiều mã chứng khoán thuộc FLC để "thổi giá, lùa gà", thu lợi bất chính 723 tỷ đồng của các nhà đầu tư. Vị này do vậy bị truy tố thêm tội "Thao túng thị trường chứng khoán".