Trước đó, từ tháng 2.2013, UBND huyện Duy Xuyên đã tiến hành kè hai bên bờ suối bằng bê tông cốt thép với tổng kinh phí 2 tỷ đồng nhằm đảm bảo an toàn, bền vững của các khu tháp trung tâm Mỹ Sơn. Tuy nhiên, khi triển khai công việc, UBND huyện chưa báo cáo UBND tỉnh và chưa được Bộ VHTTDL đồng ý, vi phạm quy định của Luật Di sản văn hóa và Điều lệ quản lý quy hoạch bảo tồn di tích Mỹ Sơn.
Do vậy, UBND tỉnh Quảng Nam yêu cầu huyện Duy Xuyên phải hoàn trả mặt bằng nguyên trạng, nạo vét trả lại dòng suối tự nhiên.
Hồng Phong