Được biết, Chương trình Đối tác Thái Bình Dương ra đời sau khi thảm họa sóng thần 2004 tàn phá nặng nề nhiều khu vực tại Đông Nam Á. Chương trình này thực hiện hỗ trợ nhân đạo do quân đội chỉ huy để đối phó với một trong những thảm họa thiên tai tàn khốc nhất trên thế giới.
Trên cơ sở thành công của hoạt động đó, tàu bệnh viện USNS Mercy (T-AH19) đã trở lại khu vực vào năm 2006 để thực hiện Chương trình Đối tác Thái Bình Dương chính thức đầu tiên. Thành phần nhân viên tham gia chương trình lần này đã được mở rộng thêm và bao gồm quân đội các quốc gia đối tác và các tổ chức NGO nhằm tăng cường khả năng cứu trợ thảm họa thiên nhiên của các quốc gia chủ nhà.
Đến nay, chương trình đã cung cấp hoạt động chăm sóc y tế cho khoảng 250.000 bệnh nhân, các dịch vụ thú y cho hơn 37.000 động vật, hoàn thành 170 dự án xây dựng, giúp phát triển hạ tầng tại Campuchia, Nhà nước Liên bang Micronesia, Indonesia, Kiribati, Palau, Papua New Guinea, Philippines, Cộng hòa quần đảo Marshall, Samoa, Solomon Islands, Timor-Leste, Tonga, Vanuatu và Việt Nam.