Một trong các điểm chính trong quá trình kiểm toán tại đơn vị là số liệu về doanh thu, lợi nhuận trước thuế và sau thuế của PVFCCo. Theo Báo cáo tài chính (BCTC) đã được kiểm toán độc lập của PVFCCo các năm 2016, 2017 đã công bố, các chỉ tiêu này lần lượt là 8.170 tỷ, 1.393 tỷ và 1.165 tỷ (2016); 8.178 tỷ, 853 tỷ và 708 tỷ (2017). Còn theo kết quả kiểm toán của KTNN, các con số này lần lượt là 8.171 tỷ, 1.400 tỷ và 1.167 tỷ (2016); 8.187 tỷ, 1.052 tỷ và 895 tỷ (2017).
Sản xuất tại nhà máy Đạm Phú Mỹ
Số liệu doanh thu 2 năm 2016 và 2017 theo kết quả kiểm toán độc lập không có khác biệt nhiều so với KTNN. Riêng số liệu lợi nhuận trước thuế và sau thuế năm 2017 theo kết quả kiểm toán của KTNN tăng 199 tỷ và 187 tỷ đồng so với kiểm toán độc lập, chủ yếu do một số nguyên nhân nghiệp vụ như sau:
Một số chi phí sửa chữa lớn do thời điểm kết thúc sửa chữa lớn vào 31.12.2017 nên công ty mẹ chưa ghi nhận giảm giá vốn vào BCTC năm 2017 (111 tỷ đồng). Công ty mẹ đã hạch toán tăng tài sản vào BCTC 9 tháng 2018.
Chi phí sửa chữa bảo dưỡng tổng thể thực tế giảm 43 tỷ đồng so với dự toán làm giảm giá vốn tương ứng. Công ty mẹ đã hạch toán hoàn nhập chi phí sửa chữa vào BCTC 6 tháng 2018.
Chi phí bán hàng giảm 9 tỷ đồng do phân bổ lại chi phí vận chuyển đối với lượng hàng tồn kho cuối kỳ.
Chi phí quản lý giảm 23 tỷ đồng do phân loại lại một số mục chi phí tiền lương ; hoàn nhập một số chi phí trích trước và phân bổ lại công cụ dụng cụ tại công ty mẹ và công ty con.
Toàn cảnh nhà máy Đạm Phú Mỹ năm 2018.
KTNN yêu cầu PVFCCo rà soát lại một số nghiệp vụ trong công tác tài chính - kế toán để phản ánh kịp thời các nghiệp vụ này trong niên độ kế toán, cụ thể là điều chỉnh số liệu trên sổ kế toán và BCTC năm 2016, 2017, đồng thời nộp bổ sung khoản thuế TNDN tăng thêm là 17 tỷ đồng do thay đổi kết quả SXKD.
Xuất hàng NPK Phú Mỹ
Báo cáo kiểm toán cũng nhận định hoạt động SXKD và công tác quản trị của PVFCCo là minh bạch, kết quả kinh doanh phản ánh đúng thực tế khi giá khí (nguyên liệu đầu vào cho sản xuất) tăng, trong khi giá sản phẩm đầu ra (phân đạm) chịu ảnh hưởng của giá thế giới, mặc dù giá bán Đạm Phú Mỹ luôn đạt mức cao nhất trong các sản phẩm cùng loại. Với kết luận của KTNN, lãnh đạo PVFCCo cho biết sẽ nghiêm túc tiếp thu, thực hiện các kiến nghị của KTNN để hoàn thiện công tác nghiệp vụ của mình.