“Đập cánh giữa không trung” kể một câu chuyện lạ lùng: Huyền, 17 tuổi, sinh viên, yêu Tùng, 18 tuổi, làm nhân viên quèn cho một công ty chiếu sáng công cộng. Tùng láu cá, giao du rộng khắp trong giới cờ bạc, đá gà, có biệt tài nhổ nước bọt bách phát bách trúng. Cả hai đều nghèo và ở trọ một mình.
Khi Huyền biết mình đã có thai thì cả cô lẫn Tùng đều hiểu mình không thể giữ cái thai lại. Tuy nhiên, để làm điều đó thì cần có tiền. Hai người tìm đủ cách để kiếm tiền và quyết định đến bệnh viện. Nhưng hết lần này đến lần khác, cái thai vẫn nằm trong bụng Huyền vì đủ mọi lý do, đồng thời bắt đầu xuất hiện những điều kỳ lạ...