Năm 2009, nữ diễn viên kết hôn với doanh nhân người Mỹ gốc Hàn Jeong Ho Young. Suốt nhiều năm qua, cô dành thời gian chăm sóc tổ ấm nhỏ với hai nhóc tì xinh xắn và ít khi xuất hiện trước truyền thông. Hai tác phẩm gần đây nhất của bà mẹ hai con là Sư Nhâm Đường, nhật ký ánh sáng (2017) và phim điện ảnh Bring me home (2019). Trở lại màn ảnh sau nhiều năm vắng bóng, Lee Young Ae thừa nhận từng mất tự tin vào diễn xuất đồng thời hứa sẽ nỗ lực hết sức để cân bằng vai trò của một người vợ, người mẹ với một diễn viên.