Tổng cục thuế đã tính toán lại và tăng số thuế phải nộp của PV GAS hơn 82,6 tỷ đồng gồm kê khai và nộp thiếu thuế GTGT, thuế nhà thầu nước ngoài, thuế TNCN và thuế TNDN. Đối với phần xử lý vi phạm hành chính về thuế, số tiền phạt hành chính và lãi chậm nộp hơn 23,3 tỷ đồng.