Sau 3 năm triển khai mô hình trường học mới VNEN ở cấp tiểu học, năm học 2015-2016, Bộ GD&ĐT mở rộng triển khai mô hình này ở cấp THCS. Theo các trường, có nhiều nỗi lo một khi áp dụng mô hình này rộng rãi hơn, nếu không đảm bảo được điều kiện và giám sát được chất lượng.