Việc thanh lý xe ô tô công được thực hiện theo hình thức bán đấu giá hoặc bán chỉ định. Trong đó, hình thức bán chỉ định được áp dụng trong trường hợp xe ô tô công đã hết giá trị còn lại theo sổ kế toán và giá trị còn lại theo đánh giá lại dưới 50 triệu đồng/xe, hoặc trường hợp đã hết thời hạn đăng ký tham gia đấu giá mà chỉ có một tổ chức, cá nhân đăng ký mua tài sản và trả giá ít nhất bằng giá khởi điểm.