Kiểm toán Nhà nước đã chỉ ra nhiều bất cập trong các dự án đầu tư công như không phù hợp với quy hoạch vùng, không phù hợp với kế hoạch đầu tư; Quyết định đầu tư chưa xác định rõ nguồn vốn, thời gian thực hiện dự án; xác định tổng mức đầu tư còn sai sót, thiếu chính xác, phải điều chỉnh nhiều lần với giá trị lớn.