Do nằm bên bờ vịnh Hạ Long (Quảng Ninh), trong quá trình hoạt động, Nhà máy tuyển than Nam Cầu Trắng gây ô nhiễm môi trường vịnh nghiêm trọng.

Theo Quyết định số 44.2007/QĐ-GTVT ngày 28.7.2007, Bộ GTVT yêu cầu trước ngày 31.12.2009 chấm dứt hoàn toàn việc chuyển tải của tàu thuyền vào cảng biển Hải Phòng tại vùng nước Hòn Gai - Quảng Ninh.

Từ ngày (22.2) Chủ tịch UBND tỉnh Quảng Ninh ban hành văn bản chỉ đạo việc bốc xúc hàng hóa trái phép trên Vịnh Hạ Long gây ô nhiễm môi trường mà báo Dân Việt đã phản ánh đến ngày báo cáo kết quả xử lý là 7 ngày (29.2)

Những gầu xúc mỗi lần ngoạm và nhả hàng đá vôi bụi lại tung lên mù mịt, bột thức ăn gia súc rơi vãi xuống biển gây ra mùi hôi thối nồng nặc, nhân viên trên các sà lan chở hàng vô tư xả rác trực tiếp xuống biển… Đó là những hình ảnh ô nhiễm do quá trình sang tải hàng hóa từ các tàu biển với sà lan trên vịnh Hạ Long (tỉnh Quảng Ninh).